Собор Святого Иоанна является заметной достопримечательностью Валлетты.

Фасад собора оформлен достаточно скромно (некоторой оригинальностью отличается одна из башен, на которой располагаются трое часов, показывающих месяц, день и время), но роскошное внутреннее обрамление компенсирует внешнюю простоту. Помимо прочего, Собор Святого Иоанна знаменит тем, что в его часовне-музее хранится шедевр Микеланджело Караваджо «Усекновение главы Иоанна Крестителя (или Иоанна Предтечи)» - исключительная религиозная композиция.

На втором этаже собора находится музей, где кроме всего прочего выставлено собрание гобеленов, выполненных по эскизам Рубенса и Пуссена.

Часто Собор Святого Иоанна ошибочно называют Кафедральным собором. На самом деле Кафедральным, то есть главным, собором Мальты является собор в Мдине.